Zellbasierte Analyse in der Systemmedizin

Fakultät Informatik/Mathematik

ESF-Gruppe DataMedAssist: Zellbasierte Analyse in der Systemmedizin

Das Projekt DataMedAssist hat sich die Analyse und Vorhersage der multi-zellulären Organisation gesunder Gewebe sowie der Initiierung und Progression entarteter Gewebestrukturen (Tumoren) als Ziel gesetzt.

Im Mittelpunkt steht die Modellierung, Implementierung und Simulation komplexer Systeme, für die kompetente Modellauswahl und datengetriebene Kalibrierung sowie die Entwicklung, Anwendung und Bewertung von Methoden der künstlichen Intelligenz im Kontext systemmedizinischer Fragestellungen.

Das Projekt leistet mit seiner systemmedizinischen Ausrichtung einen Beitrag zur Bewältigung der Herausforderungen des demographischen Wandels.  Das Projekt ergänzt die spezifisch sächsischen Forschungsschwerpunkte Künstliche Intelligenz, digitale Medizin und Systembiologie, indem es über eine interdisziplinäre Weiterentwicklung von Forschung und Lehre in diesen Bereichen den Transfer aktueller Forschungsergebnisse in die Praxis befördert.

Workshop Announcement:

Data-driven modeling for the analysis of multicellular tissue organisation 

Scope:  This workshop aims to bring together scientists working  on the interface between model-based inference of biological principles and data-driven inductive methods based on machine learning, statistical analysis and artificial intelligence.  We will explore recent advances and open problems in understanding tissue organization, both for healthy and degenerated tissues (tumors), by mathematical modeling, data-based model calibration as well as by large-scale data-analytical methods in the context of systems medicin.  

Date: 21. July 2022, 9:30am - 3:00pm, Location: Z336

Program:    9:30 - 10:30 Philipp Rossbach - Model-based prediction of an effective adhesion parameter guiding multi-type cell segregation
                  10:30 - 11:30 Florian Franke - Is cell segregation like oil and water: asymptotic versus transitory regime
                  11:30 - 12:00 Steffen Lange - Modeling age-specific incidence of colon cancer via niche competition

                  13:00 - 14:00 Katharina Loennecke - Semiautomatic Analysis of histological sections of tumor spheroids
                  14:00 - 15:00 Matthias Streller - Image segmentation of irradiated tumour spheroids by Fully Convolutional Networks                 

Registration: Please contact Prof. Dr. Voß-Böhme or Dr. Lange